The growth and replication of living eukaryotic cells are regulated by lots of signals from outside and also from inside. Cell receives various signals from other cells by messengers, such as growth factor, which are recognized by cell surface receptors. On the other hands, inside of cell, intensive signals keep firing throughout the multiple networks to process/response the signal from outside and to check/maintain the right metabolism of cells (ex. DNA replication, DNA damage response) and to monitor physiological stress of cells (ex. nutrient depletion)
These inside-cell signaling networks are often composed of sensor, switch, adaptor, transducer and effector, like a sophisticated electric machine.
Among these components, a few numbers of molecular switches control the lots of cellular process. Interestingly, these molecular switches can also integrated the information from sensor and determine the responses.
Any unexpected disruption of these signaling pathway is responsible for human disease.
Dr. Kim is interesting in the biomolecular interactions between the components of signaling pathway molecules to improve our understanding of cellular process and to give a fundamental basis of rational approach to therapeutic intervention.
우리 실험실에서는 서로 다른 단백질간, 단백질과 기질간 또는 단백질과 DNA간의 상호작용을 생화학적, 구조생물학적 방법을 통해 밝힘으로써, 생체내에서 일어나는 일련의 신호전달 활성화 과정을 분자 수준에서 이해 하고자 합니다. 이에 대한 정보를 바탕으로 각종 질병에서 일어나는 비이상적 상호작용을 설명하고, 이를 조절할수 있는 방법 개발하고자 합니다.
현재 진행 하고자 하는 연구 내용으로는
- 박테리아에서 DNA 손상 치료 단백질간의 상호 작용과 활성화 메커니즘 연구
- 식물에서 면역 수용체와 병원균 effector 단백질 간의 상호작용 연구
- 세포내 PRR이 활성화 이후 면역 항상성에 끼치는 영향 연구 등을 진행하고자 합니다.
이에 대해서 학생들이 참여 할수 있는 실험 내용으로는
- 유전자 클론닝 및 발현 벡터 최적화
- E. coli 와 Mammalian protein expression system을 이용한 단백질 발현 및 정제
- Co-ip를 이용한 단백질간의 상호작용 분석, EMSA 등을 수행할 예정입니다.